فیلوتایپینگ سویه های اشریشیا کلی نکروتوکسیژنیک و غیرنکروتوکسیژنیک جدا شده از لاشه گوسفند و بز

اشریشیا کلی قسمتی ازمیکروفلورطبیعی روده ای می باشد. این باکتری دارای باساختار ژنتیکی خاصی است که کمترین میزان نوترکیبی ژنتیکی درآن صورت می گیرد. این گونه باکتریایی درچهارگروه فیلوژنتیa,b1,b2,d تقسیم بندی می شود. سویه های اشریشیا کلی با فیلوژنی مختلف ازنظرمشخصات زیست محیطی، ویژگی های سیرتاریخی وتمایل به بیماریزایی با یکدیگر متفاوتند. سویه های نکروتوکسیژنیک اشریشیا کلی ازمهمترین پاتوتیپ های روده ای هستند که توکسین های cdt وcnf را تولید می کنند. با استفاده ازیک pcr سه گانه و بر اساس حضور یا عدم حضور سه ژن ( yja،chu و tsp) می توان گروه های فیلوژنی سویه های اشریشیا کلی را مشخص نمود. هدف از این مطالعه، شناسایی سویه های نکروتوکسیژنیک و تعیین گروه فیلوژنتیکی اشریشیا کلی های جدا شده از لاشه های گاو به روش pcr می باشد. در این مطالعه 2 جدایه نکروتوکسیژنیک و 79 جدایه غیر نکروتوکسیژنیک اشریشیا کلی مربوط به 100 لاشه گوسفند و بز مورد آزمایش pcr فیلوژنی قرار گرفت. باکتری های ذخیره شده پس از خروج از حالت انجماد در محیط آگار مغذی کشت و در آنکوباتور 37 درجه سانتی گراد به مدت 24 ساعت قرار داده شد. استخراج dna با استفاده از روش جوشاندن انجام شد. در این تحقیق دو جدایه نکروتوکسیژنیک متعلق به گروه فیلوژنی a بوده )46/2 درصد( و در تحت گروه a2 مشخص شد. از مجموع 79 جدایه غیر نکروتوکسیژنیک بیشترین فراوانی به ترتیب مربوط به گروه فیلوژنیa 29جدایه(16/53 درصد)، d 18جدایه (79/22 درصد)، b1 17جدایه (52/21 درصد)، b2 2جدایه(53/2 درصد)، مشخص شد و در تحت گروه b2-1 جدایه های شناسایی نشد. کلمات کلیدی: اشریشیا کلی، فیلوژنتیک، نکروتوکسیژنیک، لاشه، گوسفند، بز